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Prof. Claudia Bauzer Medeiros presents a talk on eScience and experiment reproducibility at Texas A&M University

Talk abstract -- eScience can be defined as joint research in Computer Science and other domains, to let scientists from these domains conduct their research faster, better or in a different way, while at the same time advancing the state of the art in Computer Science. As such, it involves joint cooperation of computer scientists with researchers from,e.g., (A)rchaeology to (Z)oology, covering all knowledge domains.

Friday, February 17, 2017 - 15:23
Pós-Doutorado na área de Física com Bolsa da FAPESP

Agência FAPESP – O Instituto de Física da Universidade Estadual de Campinas (Unicamp) oferece duas oportunidades de Pós-Doutorado – em Modelagem Computacional de Materiais e em Física – com Bolsa da FAPESP. O prazo de inscrição encerra em 18 de fevereiro.
As duas Bolsas estão vinculadas a projetos desenvolvidos no âmbito do Centro de Engenharia e Ciências Computacionais (CECC), um dos Centros de Pesquisa, Inovação e Difusão (CEPIDs) apoiados pela FAPESP.
Bolsistas integrarão projetos vinculados ao Centro de Engenharia e Ciências Computacionais na Unicamp

Tuesday, February 7, 2017 - 13:18
Converting scripts into reproducible Workflow Research Objects

Scientific discovery and analysis are increasingly computational and data-driven. While scripting languages, such as Python, R and Perl, are the means of choice of the majority of scientists to encode and run their data analysis, scripts are generally not amenable to reuse or reproducibility. Scripts do rarely get reused or even shared with third party scientists. We argue in this paper that the reproducibility of scripts can be promoted by converting them into workflow research objects.

Friday, November 25, 2016 - 15:53
BIPMed busca parcerias para ampliar banco público de dados genômicos e clínicos

Lançado há um ano, a Brazilian Initiative on Precision Medicine (BIPMed), o primeiro banco público de dados genômicos da América Latina, já reúne informações de 254 indivíduos da região de Campinas, interior de São Paulo.
Os voluntários passaram pelo sequenciamento completo do exoma – parte do genoma onde ficam os genes codificadores de proteína e, portanto, onde há mais chance de ocorrerem mutações causadoras de doenças.

Thursday, November 17, 2016 - 12:28
INVITATION BIPMED: ONE YEAR AND FORWARD

On November 13, 2015, BIPMed launched the first public genomic database in Latin America (bipmed.iqm.unicamp.br). The main objective of this initiative is to promote the sharing of genomic and phenotypic data, respecting international guidelines for the ethical and responsible work with this type of private information. These guidelines have been proposed by the Global Alliance for Genomics and Health (https://genomicsandhealth.org/).

Thursday, October 13, 2016 - 14:35
Prof. Maurice De Koning e colaboradores descobrem propriedades inusitadas do Hélio sólido em baixíssimas temperaturas

Usando técnicas do estado-da-arte de simulação computacional de sistemas quânticos, o Prof. Maurice De Koning e colaboradores desvendam propriedades "plásticas" do Hélio sólido, atribuídas a efeitos genuinamente quânticos deste material quando submetido a temperaturas próxima do zero absoluto. O trabalho foi publicado na prestigiosa Phys. Rev. Letts. Parabens ao Prof. Maurice e sua equipe.

Friday, October 7, 2016 - 11:03
Pesquisadores brasileiros descobrem inesperada propriedade do grafeno

O grafeno é um dos materiais mais estudados na atualidade. Justifica-se: constituído por uma única camada de átomos de carbono, dispostos em uma rede bidimensional de trama hexagonal, o grafeno é extremamente fino, leve e resistente. Agreguem-se propriedades como transparência, flexibilidade, alta condutividade elétrica e térmica e baixo custo de produção para que o horizonte de aplicações seja praticamente ilimitado.

Thursday, September 1, 2016 - 14:41
Um ecossistema federado para compartilhamento de dados genômicos

Em comentário sobre o tema publicado na revista Science, equipe da The Global Alliance for Genomics and Health menciona exemplo da Brazilian Initiative on Precision Medicine (BIPMed). A importância de se compartilhar dados de estudos genômicos para fazer avançar o tratamento de doenças foi tema de um comentário publicado (http://science.sciencemag.org/content/352/6291/1278) na revista Science, em junho, pela equipe do consórcio The Global Alliance for Genomics and Health (GA4GH). Leia mais clicando em Full Article URL.

Monday, August 22, 2016 - 10:58
Giant and Tunable Anisotropy of Nanoscale Friction in Graphene

The nanoscale friction between an atomic force microscopy tip and graphene is investigated using friction force microscopy (FFM). During the tip movement, friction forces are observed to increase and then saturate in a highly anisotropic manner. As a result, the friction forces in graphene are highly dependent on the scanning direction: under some conditions, the energy dissipated along the armchair direction can be 80% higher than along the zigzag direction.

Friday, August 19, 2016 - 14:56
Loosing plant cell walls: Molecular dynamics simulations of bacterial expansin on the cellulose surface

Expansins are disruptive proteins that loosen growing plant cell walls and can enhance the enzymatic hydrolysis of cellulose when mixed with cellulases. The canonical expansin structure consists of one domain responsible for substrate binding (D2) and another domain (D1) of unknown function, but essential for activity. Although the effects of expansins on cell walls and cellulose fibrils are known, the molecular mechanism underlying their biophysical function is poorly understood. Using computational molecular dynamics simulations, CCES scientists

Friday, August 19, 2016 - 11:02

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